El financiamiento es fiscal a través de la Ley de Presupuestos. Existe también otros medios de financiación que permite la Ley 21.067 en su artículo 20, que son:
Los aportes de la cooperación internacional que se reciba a cualquier título para el cumplimiento de sus objetivos.
Los bienes que se transfieran a la Defensoría o que ésta adquiera.
